Universitets- og høgskolerådets styre vedtok på møte 21. juni 2000 å opprette tre sektorovergripende utvalg:
Administrasjonsutvalg, forskningsutvalg og utdanningsutvalg (tidligere studieutvalget). Bibliotekutvalget ble vedtatt opprettet på styremøtet 21. mai 2001. Nasjonalt utvalg for universitetsmuseene videreføres. UHR har også sekretærfunksjon for kvinner i forskning (komite for integreringstiltak) og Lærebokutvalget for høyere utdanning.
- Forskningsutvalget
- Forskningsutvalget er et rådgivende og koordinerende utvalg for Universitets- og høgskolerådet i saker som gjelder forskningspolitikk og forskerutdanning.
- Utdanningsutvalget
- Utdanningsutvalget er et rådgivende og koordinerende utvalg for Universitets- og høgskolerådet i saker som gjelder utdanningsstrategiske og utdanningspolitiske spørsmål.
- Administrasjonsutvalget
- Administrasjonsutvalget er et rådgivende og koordinerende utvalg for Universitets- og høgskolerådet i saker som gjelder administrative fellesoppgaver innenfor medlemsinstitusjonenes forvaltningsområde.
- Bibliotekutvalget
- Bibliotekutvalget er et rådgivende og koordinerende utvalg for Universitets- og høgskolerådet i saker som gjelder bibliotek- og informasjonstjenester.
- Museumsutvalget
- Museumsutvalget er et rådgivende og koordinerende utvalg for Universitets- og høgskolerådet i saker som gjelder samarbeid og koordinering innen universitetsmuseenes arbeidsområde.
- Lærebokutvalget
- Lærebokutvalget for høyere utdanning er et utvalg som fordeler de midlene Stortinget setter av på statsbudsjettets kap 281 post 78 Tilskudd til utgivelse av læremidler. Bevilgningen gjelder både tilskudd til utgivelser av læremidler på nynorsk for å bedre den språklige likestillingen for bøker på dette nivået, og generelt til produksjon av læremidler i små opplag. For 2010 er det satt av 4,6 millioner til ordningen. Søknadsfristene er 1. mars og 1. oktober hvert år.